Fastq emoji

Fastqe egy egyszerű program (python nyelven), amellyel minden egyes pozicióra kiszámolhatjuk az átlag, valamint a min/max minőség értékeket és azokat emojiként jeleníti meg.

fastq minőség értékek emoji

Telepítés és használata:

A pip-el könnyen telepíthetjük:

pip install fastqe

Használata is egyszerű:

fastqe [--bin] [--min] [--max] [FASTQ_FILE ...]

 

Példa

fastqe test.fastq

fastqe --min test.fastq

fastqe --max test.fastq

Ha a --bin argumentumot is megadjuk, akkor az alábbiak szerint jeleníti meg az egyes minőségi értékeket.

Bin Emoji
N 🚫
2-9 💀
10–19 💩
20–24 ⚠️
25–29 😄
30–34 😆
35–39 😎
≥ 40 😍

 

Leave a reply